Nếu như dịp cận lễ 2/9/2019, sân ga tấp người thì nay mọi thứ vắng vẻ. Do ảnh hưởng của dịch Covid-19 nên thời gian qua, nhiều tuyến tàu đã dừng chạy, chỉ duy trì 2 chuyến Bắc - Nam. Điều này đã khiến ngành đường sắt nói chung và Ga Sài Gòn nói riêng bị thiệt hại nặng nề.

Ngày 29/8 dù là ngày đầu tiên chạy lại các tuyến tàu từ TP.HCM đi một số tỉnh miền Trung để phục vụ lễ 2/9 nhưng khách đến mua vé tàu rất ít dù giá vé cho dịp lễ không tăng. Có khoảng 12.500 chỗ phục vụ cho dịp lễ 2/9.

Để đảm bảo an toàn, nhà ga lưu ý hành khách phải tuân thủ nghiêm ngặt quy định phòng, chống dịch như đeo khẩu trang, đo thân nhiệt... Trước đó, công tác khử khuẩn các toa tàu cũng đã được thực hiện.

Nếu như trước đây tàu nhanh chủ yếu để chở khách thì nay do lượng khách không nhiều nên Ga Sài Gòn quyết định đóng mới và đưa vào hoạt động thêm 8 toa để chở hàng. Các toa này sẽ được nối vào với tàu khách chạy tuyến Bắc - Nam. Đây được xem là giải pháp phù hợp để có thêm kinh phí duy trì hoạt động trong giai đoạn khó khăn hiện nay.